MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880203

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013167	GATG	2	8	204	211	25 %	25 %	50 %	0 %	256823862
2	NC_013167	TAA	3	9	214	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823862
3	NC_013167	T	6	6	228	233	0 %	100 %	0 %	0 %	256823862
4	NC_013167	AACT	2	8	267	274	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
5	NC_013167	ATT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
6	NC_013167	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823862
7	NC_013167	GAC	2	6	358	363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823862
8	NC_013167	AATATC	2	12	367	378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256823862
9	NC_013167	TCT	2	6	395	400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823862
10	NC_013167	ATT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823862
11	NC_013167	T	6	6	510	515	0 %	100 %	0 %	0 %	256823862
12	NC_013167	TAAC	2	8	528	535	50 %	25 %	0 %	25 %	256823862
13	NC_013167	CTAATT	2	12	568	579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256823863
14	NC_013167	TTC	2	6	607	612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823863
15	NC_013167	AGATT	2	10	654	663	40 %	40 %	20 %	0 %	256823863
16	NC_013167	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823863
17	NC_013167	AGTT	2	8	707	714	25 %	50 %	25 %	0 %	256823863
18	NC_013167	TCC	2	6	828	833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
19	NC_013167	ATCT	2	8	847	854	25 %	50 %	0 %	25 %	256823863
20	NC_013167	TCC	2	6	865	870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823863
21	NC_013167	AT	3	6	1428	1433	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
22	NC_013167	GA	3	6	1456	1461	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
23	NC_013167	ATCCA	2	10	1510	1519	40 %	20 %	0 %	40 %	256823864
24	NC_013167	ACC	3	9	1559	1567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
25	NC_013167	GTA	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
26	NC_013167	CCTT	2	8	1644	1651	0 %	50 %	0 %	50 %	256823864
27	NC_013167	CCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823864
28	NC_013167	T	7	7	1732	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
29	NC_013167	GA	3	6	1849	1854	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
30	NC_013167	AGC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
31	NC_013167	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
32	NC_013167	CTG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
33	NC_013167	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823864
34	NC_013167	TAG	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823864
35	NC_013167	TGT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
36	NC_013167	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
37	NC_013167	ATTA	2	8	2036	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
38	NC_013167	T	6	6	2051	2056	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
39	NC_013167	TTG	3	9	2168	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
40	NC_013167	T	7	7	2192	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
41	NC_013167	TTG	3	9	2213	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
42	NC_013167	AGA	2	6	2222	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
43	NC_013167	TTAA	2	8	2256	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
44	NC_013167	TTA	2	6	2286	2291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
45	NC_013167	TAT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
46	NC_013167	AAGTA	2	10	2381	2390	60 %	20 %	20 %	0 %	256823864
47	NC_013167	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823864
48	NC_013167	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
49	NC_013167	CTC	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
50	NC_013167	TTTG	2	8	2520	2527	0 %	75 %	25 %	0 %	256823864
51	NC_013167	T	6	6	2646	2651	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
52	NC_013167	AT	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
53	NC_013167	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
54	NC_013167	GATTA	2	10	2753	2762	40 %	40 %	20 %	0 %	256823864
55	NC_013167	GA	3	6	2764	2769	50 %	0 %	50 %	0 %	256823864
56	NC_013167	TTG	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
57	NC_013167	TGAG	2	8	2808	2815	25 %	25 %	50 %	0 %	256823864
58	NC_013167	TAA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
59	NC_013167	T	7	7	2913	2919	0 %	100 %	0 %	0 %	256823864
60	NC_013167	ATTTA	2	10	2921	2930	40 %	60 %	0 %	0 %	256823864
61	NC_013167	TCT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
62	NC_013167	AATT	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	256823864
63	NC_013167	CTC	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
64	NC_013167	GTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823864
65	NC_013167	AGTTAA	2	12	3014	3025	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256823864
66	NC_013167	AAT	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
67	NC_013167	TTA	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823864
68	NC_013167	CATATT	2	12	3217	3228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256823864
69	NC_013167	TCC	2	6	3278	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823864
70	NC_013167	TAA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
71	NC_013167	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823864
72	NC_013167	GCT	2	6	3411	3416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823864
73	NC_013167	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823864
74	NC_013167	AGA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823864
75	NC_013167	TTAG	2	8	3495	3502	25 %	50 %	25 %	0 %	256823865
76	NC_013167	TCTTT	2	10	3509	3518	0 %	80 %	0 %	20 %	256823865
77	NC_013167	TGC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823865
78	NC_013167	CT	3	6	3557	3562	0 %	50 %	0 %	50 %	256823865
79	NC_013167	CAAT	2	8	3794	3801	50 %	25 %	0 %	25 %	256823866
80	NC_013167	AGG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823866
81	NC_013167	AGC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
82	NC_013167	CGTC	2	8	3845	3852	0 %	25 %	25 %	50 %	256823866
83	NC_013167	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
84	NC_013167	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
85	NC_013167	TGG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823866
86	NC_013167	GAT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
87	NC_013167	GA	3	6	4091	4096	50 %	0 %	50 %	0 %	256823866
88	NC_013167	GAT	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
89	NC_013167	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
90	NC_013167	GAT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
91	NC_013167	CTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
92	NC_013167	TGA	3	9	4200	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
93	NC_013167	GTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
94	NC_013167	TGA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823866
95	NC_013167	TTG	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
96	NC_013167	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823866
97	NC_013167	CGA	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
98	NC_013167	TTC	2	6	4511	4516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
99	NC_013167	CCG	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256823866
100	NC_013167	TTC	2	6	4580	4585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
101	NC_013167	GATG	2	8	4594	4601	25 %	25 %	50 %	0 %	256823866
102	NC_013167	T	6	6	4739	4744	0 %	100 %	0 %	0 %	256823866
103	NC_013167	TCT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823866
104	NC_013167	GTT	2	6	4803	4808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823866
105	NC_013167	GCA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823866
106	NC_013167	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823866
107	NC_013167	ATC	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823866
108	NC_013167	CGT	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823866
109	NC_013167	ATT	2	6	4925	4930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823866
110	NC_013167	T	6	6	4993	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
111	NC_013167	TCT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
112	NC_013167	T	6	6	5073	5078	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
113	NC_013167	CCA	3	9	5166	5174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823867
114	NC_013167	GGT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823867
115	NC_013167	AGC	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823867
116	NC_013167	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
117	NC_013167	G	7	7	5464	5470	0 %	0 %	100 %	0 %	256823867
118	NC_013167	GGA	2	6	5481	5486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823867
119	NC_013167	TCA	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
120	NC_013167	T	6	6	5571	5576	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
121	NC_013167	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823867
122	NC_013167	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823867
123	NC_013167	TTC	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
124	NC_013167	TTG	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823867
125	NC_013167	A	6	6	5702	5707	100 %	0 %	0 %	0 %	256823867
126	NC_013167	C	9	9	5718	5726	0 %	0 %	0 %	100 %	256823867
127	NC_013167	AATT	2	8	5860	5867	50 %	50 %	0 %	0 %	256823867
128	NC_013167	CTT	2	6	5889	5894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
129	NC_013167	GACC	2	8	5901	5908	25 %	0 %	25 %	50 %	256823867
130	NC_013167	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
131	NC_013167	T	6	6	5953	5958	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
132	NC_013167	GCT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
133	NC_013167	GAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823867
134	NC_013167	TGC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823867
135	NC_013167	GCAA	2	8	6114	6121	50 %	0 %	25 %	25 %	256823867
136	NC_013167	CTT	2	6	6129	6134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823867
137	NC_013167	T	6	6	6162	6167	0 %	100 %	0 %	0 %	256823867
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142	NC_013167	TGAT	2	8	6786	6793	25 %	50 %	25 %	0 %	256823868
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256	NC_013167	GAAC	2	8	12642	12649	50 %	0 %	25 %	25 %	256823879
257	NC_013167	CT	3	6	12716	12721	0 %	50 %	0 %	50 %	256823879
258	NC_013167	TCT	3	9	12762	12770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823879
259	NC_013167	CTTG	2	8	12840	12847	0 %	50 %	25 %	25 %	256823879
260	NC_013167	CAGC	2	8	12937	12944	25 %	0 %	25 %	50 %	256823879
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395	NC_013167	A	6	6	21819	21824	100 %	0 %	0 %	0 %	256823889
396	NC_013167	C	6	6	21941	21946	0 %	0 %	0 %	100 %	256823889
397	NC_013167	GA	3	6	21951	21956	50 %	0 %	50 %	0 %	256823889
398	NC_013167	GTT	2	6	21992	21997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823889
399	NC_013167	ATTG	2	8	22011	22018	25 %	50 %	25 %	0 %	256823889
400	NC_013167	TCAA	2	8	22122	22129	50 %	25 %	0 %	25 %	256823890
401	NC_013167	AGG	2	6	22184	22189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823890
402	NC_013167	GTT	2	6	22215	22220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.